En verano de 2019, con el equipo clasificado para la Liga de Campeones y recién campeón de la Copa del Rey, nadie podía presagiar la crisis institucional que se produciría en el club. El rival en octavos de final de la Liga de Campeones fue la Atalanta BC de la ciudad de Bérgamo en la región de la Lombardía, justo la que en febrero de 2020 se convirtió en el principal foco europeo de la expansión de la pandemia por coronavirus. Era entonces una ciudad amurallada, con un trazado urbanístico árabe clásico y tres barrios bien diferenciados: el barrio de Al Hawd (o el Aljibe), el de la Musalla y el principal, la Medina (por donde corre hoy la actual calle de la Almedina). Empezó a jugar en 2004 en las categorías inferiores de la Agrupación Deportiva Parla de su ciudad natal. A finales de julio, el consenso para los nuevos fichajes y las decisiones respecto a los jóvenes talentos enfrentó al área técnica de Mateu Alemany, Pablo Longoria y Marcelino García Toral con el máximo accionista, Meriton Holdings, liderado por Peter Lim y por el presidente del club Anil Murthy.

En la Copa de Italia y después de eliminar a la Juventus y al Inter (en cuartos de final y semifinal, respectivamente), disputó la final ante la Sampdoria, ante la cual cayó por un global de 1:3. El 20 de enero de aquella temporada, debutó ante el Udinese, Paolo Maldini (uno de los máximos emblemas en la historia del Milan). En el segundo tiempo solo Messi puso en peligro la portería de Jaume Doménech, y logró recortar distancias pero finalmente el 1-2 hizo que el Valencia levantase su 8.ª Copa del Rey. Peter Lim en Valencia aclarando que su objetivo es «que el club crezca a largo plazo». Valencia sin haber ningún protocolo de seguridad en el aeropuerto. Uno de sus futbolistas, Papu Gómez, incluso reaccionó de forma despectiva cuando en el aeropuerto le preguntaron por si le preocupaba el virus. El rápido aumento de la población universitaria también llevó, en 1928, a acabar con el privilegio exclusivo de la Universidad Central para otorgar el título de doctor, aunque esta capacidad no fue adquirida de forma efectiva por ninguna universidad hasta el año 1953, cuando se otorgó el derecho a las universidades de Salamanca y Barcelona. El Real Madrid C. F. tuvo que esperar hasta la temporada 1931-32 para alzar su primer título de Liga, ganando el segundo de forma consecutiva.

El capitán Dani Parejo, que empezó a ser convocado por Luis Enrique para la selección española, se convirtió en el mejor jugador de la temporada y recuperó por completo el cariño de la afición. Exfutbolistas como Roberto Fabián Ayala, Santiago Cañizares, Javier Subirats, Mario Alberto Kempes, el actor valenciano Enrique Arce y el exciclista Ángel Casero mostraron su apoyo a través de una nueva plataforma de protesta. Así, la ministra de Hacienda, María Jesús Montero, reformó el Departamento de Hacienda creando este nuevo órgano directivo con rango de subsecretaría con el objetivo de «que la persona titular de la misma cuente con el rango jerárquico adecuado para llevar a cabo una mejor interlocución con las Instituciones europeas y pueda coordinar adecuadamente las actuaciones que en esta materia se implementen con el resto de departamentos ministeriales». En cuanto a las repercusiones económicas, el club comunicó a sus cerca de 400 empleados el 21 de marzo que no sería necesario llevar a cabo un ERTE que causaría despidos temporales de parte de sus empleados, y que Peter Lim había puesto a disposición del club una línea de crédito abierta por si surgieran la necesidad de cubrir el pago de salarios en el contexto de crisis.

Las salidas de estos dos últimos fueron considerados parte de la purga que el presidente Anil Murthy estaba llevando a cabo en todos los estamentos del club para que solo quedase gente de su entera confianza y fieles a las órdenes de Meriton Holdings. En primer lugar se puso punto final a la presencia del grupo de animación Curva Nord en Mestalla reconvirtiendo la grada de animación en una grada joven para menores de 25 años, lo que produjo una división definitiva del club con parte de la afición y el fin de la animación en Mestalla como la habíamos conocido hasta ese momento. Con el equipo fuera de competiciones europeas, el máximo accionista planteó una revolución en la plantilla para reducir así su coste y evitar además la continuidad de jugadores contrarios a su política al frente del club. Las quejas no fueron solo sociales y de exempleados sino hasta del propio técnico Javi Gracia antes de la disputa de la primera jornada, en la que declaró estar triste, decepcionado, poco esperanzado con la llegada de refuerzos y observando cómo la plantilla se iba debilitando con cada salida. Ocupó su lugar el debutante técnico Albert Celades, con experiencia únicamente en la selección Sub-21 y cuyo agente formaba parte del entorno de Jorge Mendes, principal asesor deportivo y amigo personal de Peter Lim.